Li er sá síðasti í röð háttsettra embættismanna með tengsl við herinn sem hafa verið látnir taka pokann sinn á síðustu misserum en utanríkisráðherrann Qin Gang var fjarlægður úr embætti í júlí síðastliðnum.
Qin og Li hafa einnig verið látnir víkja úr ríkisráðinu.
Boðað hefur verið til ráðstefnu er varðar varnarmál í þessari viku.
Reuters greindi frá því í september að Li sætti rannsókn vegna gruns um spillingu, meðal annars í tengslum við kaup á búnaði. Li sást síðast 29. ágúst á öryggisráðstefnu með fulltrúum Afríkuríkja.
Li hafði aðeins setið í stól varnarmálaráðherra í nokkra mánuði en hann tók við embættinu í mars.
Ráðherrann fyrrverandi sætti refsiaðgerðum af hálfu Bandaríkjanna sökum samnings milli Kína og Rússlands um kaup Kínverja á rússneskum vopnabúnaði. Aðgerðirnar eru sagðar hafa verið Li erfiðar en hann neitaði meðal annars að funda með Lloyd Austin, varnarmálaráðherra Bandaríkjanna, fyrr á árinu.
Það vekur athygli að bæði Li og Qin, sem var utanríkisráðherra í aðeins sjö mánuði, voru báðir sagðir hafa vera nánir Xi Jinping forseta Kína.